Η εταιρεία «ΕΓΝΑΤΙΑ ΟΔΟΣ Α.Ε.», από την αρχή της κατασκευής της Εγνατίας Οδού μέχρι σήμερα που είναι σε πλήρη λειτουργία, παρακολουθεί και καταγράφει τις περιβαλλοντικές συνθήκες, εντοπίζει τις επιπτώσεις της Οδού στο περιβάλλον και φέρει εις πέρας, με αποτελεσματικότητα, τις απαραίτητες ενέργειες για την προστασία του φυσικού και ανθρωπογενούς περιβάλλοντος, σε μια εποχή κατά την οποία η περιβαλλοντική προστασία αποτελεί αντικείμενο προς συζήτηση και δράση σε παγκόσμιο επίπεδο.
Μέχρι σήμερα, οι ενέργειες αυτές γινόταν τόσο με ίδια μέσα όσο και με τη συνεργασία άλλων φορέων.
Από τις 15 Μαΐου 2013, η «ΕΓΝΑΤΙΑ ΟΔΟΣ Α.Ε.» παρέλαβε κινητό εργαστήριο πραγματοποίησης περιβαλλοντικών μετρήσεων στο πλαίσιο του έργου Environmental Highway Οbservatory (E-Highway), του διασυνοριακού προγράμματος συνεργασίας INTERREG Ελλάδα – ΠΓΔΜ ΙΡΑ 2007 – 2013.
Μέσω του εξοπλισμού του κινητού αυτού εργαστηρίου θα παρακολουθούνται επί της Εγνατίας Οδού βασικοί περιβαλλοντικοί δείκτες: αέρια ρύπανση, ρύπανση υδάτων, ηχορρύπανση, σύμφωνα με τις απαιτήσεις του έργου «Ε-Highway», αλλά και σύμφωνα με τα προβλεπόμενα στις Κοινές Υπουργικές Αποφάσεις έγκρισης Περιβαλλοντικών Έργων που διέπουν τα τμήματα της Εγνατίας Oδού.
Στόχος όλων, διοίκησης και εργαζομένων, είναι η Εγνατία Οδός των 670 χιλιομέτρων, πέραν από άξονα μεταφοράς και επικοινωνίας, να αποτελεί και άξονα βιώσιμης ανάπτυξης.